然而，跟谷歌眼镜、虚拟现实等这些新技术一样，3D打印也面临着各种反对的声音――它会不会被用来打印违禁品？会不会用于不法用途？
说到违禁品，人们第一时间想到的就是枪支。虽然那把叫做“解放者”的全球首支3D打印手枪还很粗糙，枪膛用不了几下就要更换，但如果在未来的某一天，任何人都能轻易在家中打印出一支AK47、狙击步枪、霰弹枪，甚至是火箭炮之类的武器，先不说政府会不会采取行动，但想到身边的邻里、朋友们都拥有这些杀伤武器，相信不少人会感到寝食难安。
另外，因为3D打印几乎什么都能制作，像堕胎药等违禁药物，甚至诸如可卡因、农药之类的毒品、剧毒物，都有可能通过购买相关的原料，然后利用3D打印过程中的物理、化学变化来合成。与明晃晃地到“X宝”、“XBay”或者在线黑市上购买的方式相比，这种“DIY”式的违禁药和毒品显得更为隐蔽，更难受到监管。
而提到不法用途，最大的争议就是各种山寨和盗版。
平时喜欢淘宝的朋友都知道，网上除了有低价的水货，还有不少高仿甚至伪劣的产品――耐克、阿迪达斯的鞋子，鳄鱼、Playboy的服装，LV的手提包，乐高、Bandai的玩具和模型，或者三星、HTC的手机……你想得到的、想不到的，都有相应的“山寨兄弟”存在。
传统的仿冒行业虽然在劳动力和原料方面的成本要低得多，但由于传统的生产设备和正版厂商的比起来相差不多，高昂的设备成本也限制了山寨仿制的传播。不过，如果将3D扫描仪和3D打印机结合起来使用，即使是个人作坊，只要有实物或者相应的图纸，山寨出一批几可乱真的运动鞋、玩具、手机外壳也不需要花费多少时间，而制作的成本却只有正版的几分之一、甚至几十分之一。
