世界卫生组织将医疗信息化的发展分为三个阶段：医院管理和临床信息化、区域卫生信息化、个人健康管理信息化：
第一阶段是建设医院管理系统（HIS），主要针对医院收费、挂号等基础服务，在HIS的基础上，医院将以诊疗为核心进行电子病历等临床信息化（CIS）系统的建设。
第二阶段，在CIS系统与HIS系统实现数据互联互通、实时共享之后，通过区域内多家医疗机构诊疗业务和管理信息的集成整合，打造区域医疗资源的互联互通和合理转移。
第三阶段，打造互联网医疗，对广大个体健康管理进行信息化，包括在线问诊、医药配送等。
