论文的漏洞
这篇论文的研究方法没什么问题，但最大的缺陷在于样本的搜集不足以反映病毒现状的普遍性。兰州大学生态学创新研究院赵序茅曾表示，病毒是会更新换代的，而这篇论文中所引用的武汉病毒样本采集时间都比较晚。
众所周知，在疫情前期，武汉疫情非常汹涌，当时医疗人力极度短缺的情况下，自然没有多余精力进行病毒采样。直到这种问题得到缓解，才陆续开始了病毒的采样。而在湖北省外以及海外其他国家，则医疗资源相对充分，查出一个确诊就采样一个。因此这篇论文引用的来自武汉甚至华南海鲜市场的病毒样本都是孙辈病毒并不一定是因为武汉没有祖辈病毒，而是因为病毒子孙太厉害，祖辈病毒逐渐被子辈、孙辈病毒又抢占了生存空间已经更新换代了。而美国的患者少，又隔离及时，所以病毒更新换代不容易。
另一方面，研究的病毒数量也不够多，只采集了93个样本，其中来自中国的病毒样本54个，中国的样本中来自湖北的又是22个，而且这些样本还主要来自几家定点医院。仅仅以来自几家医院的54、22个新冠病毒样本代表全国近八万、湖北六万多的确诊情况，显然不具有说服力。
最后，跟H13、H38单倍体病毒有关的广东首例患者和美国首例患者，通过调查他们的接触史，都能找到跟武汉有关。他们分别在2019年12月底和2020年1月初在武汉活动过，返回深圳和美国被确诊。因此，他们所携带的祖辈病毒不仅不能证明源自美国传入，反而更可能是来自武汉。
总之，要对新型冠状病毒进行更可靠的溯源，还需要对武汉早期的病毒样本进行分析。
